Tutorial for compilation on MacOS 10.8 MountainLion (french)¶

by Olivier Coulon

Pour avoir quelque-chose qui marche presque complètement.¶

• Installer Xcode puis dans Xcode installer les commandes en ligne, pour avoir gcc.
• Installer aussi homebrew, c'est nécessaire pour quelques packages. Mais je ne l'utilise pas pour scipy, numpy, etc…, pour éviter d'avoir plusieurs python sur le système.

• Utiliser le python du système.
• On utilise le ScipySuperpack qui se charge des choses difficiles comme SciPy ou NumPy.:
  https://raw.github.com/fonnesbeck/ScipySuperpack/master/install_superpack.sh
  Le script est aussi ici

• On installe QT4:
  Maintenant c'est là: http://releases.qt-project.org/qt4/source/qt-mac-opensource-4.8.3.dmg la seule version à supporter Mountain Lion. C'est OK

• On installe SIP:
  http://www.riverbankcomputing.co.uk/static/Downloads/sip4/sip-4.13.2.tar.gz

  python configure.py
  make
  sudo make install

  Attention, l'exécutable doit être détecté. Aller linker vers /usr/bin:

  ln -s /usr/local/sip-4.13.2/sipgen/sip /usr/bin/sip

• On installe PyQt.
  J'ai téléchargé http://sourceforge.net/projects/pyqt/files/PyQt4/PyQt-4.9.4/PyQt-mac-gpl-4.9.4.tar.gz/download
  Puis:

  python configure.py
  make

  -> Ca marche DIRECT !

• Installation qwt:
  http://sourceforge.net/projects/qwt/
  Il faut, pour l'instant utiliser le qwt-5.2.1, la version 6.0.1 ne marche pas.

  Faut faire :

  qmake -spec macx-g++

  
  car sinon il génère des fichiers xcodes
  puis

  make
  sudo make install

  
  suivi par:
  

  sudo mkdir /usr/local/include
  sudo ln -s /usr/local/qwt-5.2.1/lib/* /usr/local/lib/
  sudo ln -s /usr/local/qwt-5.2.1/include/* /usr/local/include/

• Installation dcmtk:
  brew install dcmtk -> marche toujours pas

• installation: doxygen
  http://www.stack.nl/~dimitri/doxygen/download.html#latestsrc

• installation graphviz et dot:
  http://www.ryandesign.com/graphviz/

  puis dans le bash_profile rajouter:
  

  export HAVE_DOT=YES
  export DOT_PATH=/usr/local/graphviz-x.y/bin

• installation boost
  

  brew install boost

• installation libsigc++-2.10
  http://ftp.gnome.org/pub/GNOME/sources/libsigc++/2.2/
  on le met dans /usr/local
  Puis dans le répertoire:
  

  ./configure
  make
  make install

• installation epydocs
  http://sourceforge.net/projects/epydoc/files/latest/download

  on le met dans /usr/local puis
  

  sudo make install
  sudo make installdocs

• Il faut aller télécharger cmake sur
  http://www.cmake.org/cmake/resources/software.html, prendre le package dmg approprié et installer.

• Le fortran n'est pas trouvé. Il faut faire:
  

  sudo ln -s /usr/bin/gfortran-4.2 /usr/bin/gfortran

COMPILATION BRAINVISA:¶

• rajouter (entre autres) le path pour qmake dans le .bash_profile (pour moi: /Users/olivier/QtSDK/Desktop/Qt/474/gcc/bin/)

• installer les sources, compil de bv_maker etc…
  (https://bioproj.extra.cea.fr/redmine/projects/brainvisa-devel/wiki/How_to_compile_BrainVISA_projects)

  Mon .brainvisa/bv_maker.cfg :

  [ source $HOME/brainvisa/source ]
    + standard trunk
    + perso/coulon
    + perso/operto
    - communication
    - nuclear_processing trunk
  
  [ build $HOME/brainvisa/build/bug_fix ]
    build_type = Release
    make_options = -j1
    standard bug_fix $HOME/brainvisa/source
    - soma-io
    - connectomist-*
    - communication
    - fmri
  
  [ build $HOME/brainvisa/build/trunk ]
    make_options = -j1
    standard trunk $HOME/brainvisa/source
    - soma-io
    - connectomist-*
    - communication
    - fmri

• Attention, par défaut le compilateur C++ pour moi est Clang, il faut changer la variable d'environnement:
  

  export CXX=/usr/bin/g++

  Je l'ai mise dans mon .bash_profile.

• Puis classique:
  

  bv_maker sources
  bv_maker configure
  bv_maker build